Італійський дослідник Паскаль Котте продемонстрував прихований ескіз, поверх якого Леонардо да Вінчі написав портрет. Щоб визначити лінії начерку та дослідити ескіз, йому знадобилось 14 років.

У 2004 році адміністрація Лувру дала згоду Котте на сканування картини. Річ у тому, що дослідник має апарат, що дозволяє сканувати картини з високою роздільною здатністю і ґрунтується на технології інфрачервоної фотографії. Такий пристрій дозволяє виявити найдрібніші деталі. Всього зробили 1650 знімків.

Вчений виявив, що начерк зроблений у техніці спольверо (spolvero). Щоб його виконати, да Вінчі використовував трафарет з отворами і деревне вугілля.

Дослідження пролило світло на початковий варіант портрета: на ньому поза Джоконди була дещо іншою, а у її волоссі була шпилька.